Секвенатор Ion PGM
₽ 3 000 000.00
- Описание
- Характеристики
Секвенатор Ion PGM — целевое секвенирование РНК
Настольный секвенатор Ion PGM™ предназначен для одновременного секвенирования большого количества (от 100 тыс. до 1 млн.) отдельных фрагментов ДНК. Все фрагменты ДНК распределены по лункам на поверхности чипа. Количество лунок варьирует в зависимости от производительности чипов от 1 млн (чип Ion 314) до 11 млн лунок (чип Ion 318). За 1 запуск прибор может прочитать до 1 млрд п.н. Время запуска составляет всего 1,5 часа.
Гибкая система чипов разной производительности:
- Чип Ion 314 – от 40 млн п.н.
- Чип Ion 316– от 400 млн п.н.
- Чип Ion 318– 1-2 млрд п.н.
Области приложения: малые геномы, наборы генов, малые РНК, экспрессия генов, митохондриальная ДНК, анализ SNP, HLA типирование , ChIP Seq, анализ метилирования ДНК, анализ метагеномов по генам 16S рРНК, de novo секвенирование.
Технические характеристики
| Длина прочтения | до 400 п.о. |
| Время секвенирования | 1,5 часа (при длине прочтения 100 п.о.) |
| Вес, кг | 30 |
| Размеры, мм | 610х510х530 |
| Мощность сети | Max 9A |
| Формат данных | FASTQ, SFF, BAM, VCF |
Принцип работы
Отдельные фрагменты ДНК независимым образом амплифицируются на поверхности микросфер методом эмульсионной ПЦР. Микросферы в виде взвеси наносятся на поверхность полупроводникового микрочипа. Загруженный микросферами полупроводниковый микрочип помещается в прибор, который в автоматическом режиме осуществляет подачу дезоксинуклеотидтрифосфатов и регистрирует сигналы, поступающие из каждой лунки микрочипа.
Метод секвенирования
Последовательное удлинение олигонуклеотидной затравки ДНК-полимеразой с одновременной регистрацией локального изменения pH в результате встраивания нуклеотидов.