Оборудование, расходные материалы, реактивы для лабораторных исследований
Отправить запрос

Отправить запрос









Секвенатор Ion PGM

 3 000 000.00

Бренд: Applied Biosystems
Назначение: секвенирование
  • Описание
  • Характеристики

Секвенатор Ion PGM  — целевое секвенирование РНК

Настольный  секвенатор Ion PGM™ предназначен для одновременного секвенирования большого количества (от 100 тыс. до 1 млн.) отдельных фрагментов ДНК. Все фрагменты ДНК распределены по лункам на поверхности чипа. Количество лунок варьирует в зависимости от производительности чипов от 1 млн (чип Ion 314) до 11 млн лунок (чип Ion 318). За 1 запуск прибор может прочитать до 1 млрд п.н. Время запуска составляет всего 1,5 часа.

Гибкая система чипов разной производительности:

  • Чип Ion 314 – от 40 млн п.н.
  • Чип Ion 316– от 400 млн п.н.
  • Чип Ion 318– 1-2 млрд п.н.

Области приложения: малые геномы, наборы генов, малые РНК, экспрессия генов, митохондриальная ДНК, анализ SNP, HLA типирование , ChIP Seq, анализ метилирования ДНК, анализ метагеномов по генам 16S рРНК, de novo секвенирование.

Технические характеристики

Длина прочтения до 400 п.о.
Время секвенирования 1,5 часа (при длине прочтения 100 п.о.)
Вес, кг 30
Размеры, мм 610х510х530
Мощность сети Max 9A
Формат данных FASTQ, SFF, BAM, VCF

 

Принцип работы

Отдельные фрагменты ДНК независимым образом амплифицируются на поверхности микросфер методом эмульсионной ПЦР. Микросферы в виде взвеси наносятся на поверхность полупроводникового микрочипа. Загруженный микросферами полупроводниковый микрочип помещается в прибор, который в автоматическом режиме осуществляет подачу дезоксинуклеотидтрифосфатов и регистрирует сигналы, поступающие из каждой лунки микрочипа.

 

Метод секвенирования

Последовательное удлинение олигонуклеотидной затравки ДНК-полимеразой с одновременной регистрацией локального изменения pH в результате встраивания нуклеотидов.