Оборудование, расходные материалы, реактивы для лабораторных исследований
Отправить запрос

Отправить запрос









Система секвенирования Ion Proton

 7 000 000.00

Бренд: Applied Biosystems
Назначение: секвенирование
  • Описание
  • Характеристики

Система секвенирования Ion Proton — секвенирование полного транскриптома, секвенирование мРНК

Полногеномный секвенатор Ion Proton позволяет проводить секвенирование 1-3 экзомов человека (1-8 транскриптомов) за 2-4 часа. Применение технологии полупроводникового секвенирования значительно снижает стоимость одного запуска. За один запуск прибор Ion Proton совершает около 60-80 млн прочтений, что позволяет перекрыть последовательность длиною в 10 млрд п.о. (чип Ion PI). Систему Ion Proton дополняет рабочая станция с программным обеспечением Torrent Suite Software для обработки данных.

 

60-80 млн прочтений за один запуск на чипе PI:

  • Чип Ion Proton I –  10 млрд п.н.
  • Чип Ion Proton II – 100 млрд п.н.
  • Чип Ion Proton III – 250 млрд п.н.

 

Области приложения: экзом человека, транскриптом, наборы генов, малые РНК, малые геномы, экспрессия генов, ChIP Seq, анализ метелирования ДНК, de novo секвенирование.

Технические характеристики

Длина прочтения до 200 п.о.
Время секвенирования 2 часа (при длине прочтения 100 п.о.)
Вес, кг 59
Размеры, мм 542х775х474
Мощность сети Max 18A
Формат данных FASTQ, SFF, BAM, VCF

 

Принцип работы

Отдельные фрагменты ДНК независимым образом амплифицируются на поверхности микросфер методом эмульсионной ПЦР. Микросферы в виде взвеси наносятся на поверхность полупроводникового микрочипа. Загруженный микросферами полупроводниковый микрочип помещается в прибор, который в автоматическом режиме осуществляет подачу дезоксинуклеотидтрифосфатов и регистрирует сигналы, поступающие из каждой лунки микрочипа.

 

Метод секвенирования

Последовательное удлинение олигонуклеотидной затравки ДНК-полимеразой с одновременной регистрацией локального изменения pH в результате встраивания нуклеотидов.