Система секвенирования Ion Proton
₽ 800 000.00
- Описание
- Характеристики
Система секвенирования Ion Proton — секвенирование полного транскриптома, секвенирование мРНК
Полногеномный секвенатор Ion Proton позволяет проводить секвенирование 1-3 экзомов человека (1-8 транскриптомов) за 2-4 часа. Применение технологии полупроводникового секвенирования значительно снижает стоимость одного запуска. За один запуск прибор Ion Proton совершает около 60-80 млн прочтений, что позволяет перекрыть последовательность длиною в 10 млрд п.о. (чип Ion PI). Систему Ion Proton дополняет рабочая станция с программным обеспечением Torrent Suite Software для обработки данных.
60-80 млн прочтений за один запуск на чипе PI:
- Чип Ion Proton I – 10 млрд п.н.
- Чип Ion Proton II – 100 млрд п.н.
- Чип Ion Proton III – 250 млрд п.н.
Области приложения: экзом человека, транскриптом, наборы генов, малые РНК, малые геномы, экспрессия генов, ChIP Seq, анализ метелирования ДНК, de novo секвенирование.
Технические характеристики
| Длина прочтения | до 200 п.о. |
| Время секвенирования | 2 часа (при длине прочтения 100 п.о.) |
| Вес, кг | 59 |
| Размеры, мм | 542х775х474 |
| Мощность сети | Max 18A |
| Формат данных | FASTQ, SFF, BAM, VCF |
Принцип работы
Отдельные фрагменты ДНК независимым образом амплифицируются на поверхности микросфер методом эмульсионной ПЦР. Микросферы в виде взвеси наносятся на поверхность полупроводникового микрочипа. Загруженный микросферами полупроводниковый микрочип помещается в прибор, который в автоматическом режиме осуществляет подачу дезоксинуклеотидтрифосфатов и регистрирует сигналы, поступающие из каждой лунки микрочипа.
Метод секвенирования
Последовательное удлинение олигонуклеотидной затравки ДНК-полимеразой с одновременной регистрацией локального изменения pH в результате встраивания нуклеотидов.